Alpha Legion bola XX. légiou Legiones Astartes, vedenou Alphariom a Omegonem – dvojicou primarchov, ktorých identita je zahalená tajomstvom. Ich motto “My sme Alpharius” vystihuje ich filozofiu: dezinformácie, infiltrácia a psychologická vojna.

Na rozdiel od ostatných légii Alpha Legion neoperovala z jedného domovského sveta, ale z tajných základní po celej galaxii. Počas Horovej Herezy sa pridali k zradcom, no ich skutočné motivácie zostávajú nejasné – možno chceli zachrániť ľudstvo prostredníctvom skazy Impéria.

V systéme Horus Heresy má Alpha Legion pravidlá ako Lies and Obfuscation, vďaka ktorému sú ich jednotky považované za o 2″ ďalej pre účely streľby, nabíjania a reakcií. To im umožňuje vyhýbať sa palbe a komplikovať toky nepriateľov. Ich jednotky zahŕňajú Headhunters, Lernaean Terminators, Saboteurs a hrdinov ako Exodus, Armillus Dynat alebo Alpharius samotný.